신규 룰 '스킬 배틀'은 설정한 3명의 캐릭터로 '뿌요뿌요' 혹은 '테트리스' 팀을 만들어 싸웁니다.캐릭터들은 각기 고유의 스킬을 가지고 있으며, 자신이 원하는 스킬을 가진 캐릭터로 팀을 편성할 수 있습니다. 팀을 구성하는 캐릭터의 합계 스테이터스가 팀 스테이터스에 반영됩니다.어드벤처 모드의 '스킬 배틀'에서 캐릭터 레벨을 올리거나 어드벤처 모드에서 드랍하는 아이템 카드를 장착하여 팀 스테이터스를 강화할 수 있습니다.

'스킬 배틀'에서는 새롭게 'HP'와 'MP'가 설정됩니다. 필드 윗부분의 오렌지색 게이지가 'HP'입니다.
일반적으로 '뿌요뿌요'는 빨간색 "✕"까지 쌓거나, '테트리스'는 맨 위까지 쌓으면 패배 판정이었지만 '스킬 배틀'에서는 'HP'가 남아있으면 필드가 리셋되어 퍼즐을 계속할 수 있습니다. HP가 0이 되면 패배 판정이 됩니다.
뿌요뿌요를 지우거나 테트리스에서 라인을 지우면 '방해 뿌요'나 '방해 블록'이 상대방 필드에 떨어집니다. 필드에 떨어질 때 대미지를 주면 'HP'를 줄일 수 있습니다.
팀 캐릭터 아래의 초록색 게이지가 'MP'입니다. 스킬을 사용하려면 'MP'가 필요합니다.

어드벤처 모드의 '스킬 배틀'을 플레이하면 캐릭터 레벨이 오르며 스테이터스를 강화하거나 스킬을 얻을 수 있습니다.
스테이터스 종류는 'HP', 'MP', '공격', '회복'이 있습니다. '공격'과 '방어'는 대미지에 영향을 주며 '회복'이 높아지면 'HP'와 'MP'의 자동 회복이 빨라집니다.
스킬 종류는 자동 스킬과 스페셜 스킬이 있습니다. 자동 스킬은 대전 시작 시 자동으로 발동하는 스킬이며, 캐릭터마다 설정된 각 파라미터가 상승(공격 ㅇㅇ% 상승 등)합니다.
스페셜 스킬은 대전 중에 임의로 발동하는 스킬입니다. 캐릭터 레벨이 오르면 스킬을 최대 3개까지 습득할 수 있으며, 원하는 스킬을 선택할 수 있습니다.

스킬 배틀에서 사용하는 아이템 카드는 팀당 4개까지 장착할 수 있습니다. 어드벤처 모드의 '스킬 배틀'을 플레이하여 승리하면 랜덤으로 드롭합니다. 강한 적을 쓰러트렸을 때는 스테이터스 상승 이외의 효과를 지닌 아이템 카드를 드롭하는 경우도 있습니다. 카드 파라미터나 부여되는 특수 효과는 랜덤이므로, 어드벤처 모드를 반복해서 플레이하여 강력한 카드를 모아 팀을 강화할 수 있습니다.

아이템 카드는 'HP', 'MP', '공격', '방어', '회복'의 5종류 타입이 있으며 장착하면 각각 대응하는 파라미터가 상승합니다. 또한 타입에 따른 파라미터 상승 이외에 '특수 효과'가 부여되어 있는 경우가 있습니다. '특수 효과'는 타입 외의 파라미터 상승을 비롯한 '뿌요뿌요 2연쇄 공격력 상승', '테트리스 2라인 지우기 공격력 상승' 등 파라미터 이외의 플러스 효과도 있습니다.
아이템 카드는 레벨이 존재하며 레벨에 따라 부여되는 파라미터 상한이나 부여되는 '특수 효과'의 종류 및 개수가 상승합니다. 카드 레벨은 캐릭터 레벨과 달리 획득했을 때 정해지며 바뀌지 않습니다.